<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"><head><meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=utf-8"><meta name=Generator content="Microsoft Word 12 (filtered medium)"><!--[if !mso]><style>v\:* {behavior:url(#default#VML);}
o\:* {behavior:url(#default#VML);}
w\:* {behavior:url(#default#VML);}
.shape {behavior:url(#default#VML);}
</style><![endif]--><style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:Helvetica;
        panose-1:2 11 6 4 2 2 2 2 2 4;}
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Tahoma;
        panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri","sans-serif";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
p
        {mso-style-priority:99;
        margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman","serif";}
span.EmailStyle18
        {mso-style-type:personal;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:windowtext;}
span.EmailStyle19
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:#1F497D;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-size:10.0pt;}
@page WordSection1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]--></head><body lang=EN-US link=blue vlink=purple><div class=WordSection1><p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'>Thanks Tim. I was able to make this change work for my case … I had to do the same thing with both C and Fortran that you did with Fortran.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'>I can also see why the fix is not comprehensive. The method does not fix “Fortran_HL”, but rather makes  hdf5hl_fortran available by lumping it in with “Fortran” (same for C).  Because the two are lumped together, if someone only needed hdf5 and did not have hdf5_hl installed, the script would fail. Also, the patch would need to eliminate the components HL and Fortran_HL … since it designs away from making these available.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'>There is probably a fix that would preserve these as independent components, though I don’t have the experience with cmake to write it. The part of the script that looks for libraries is looping over languages rather than components. The C and Fortran components get found because they are also language names. To really fix this right, we would need to change the logic to search all the components. <o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:#1F497D'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><div><div style='border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in'><p class=MsoNormal><b><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'>From:</span></b><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'> Tim Gallagher [mailto:tim.gallagher@gatech.edu] <br><b>Sent:</b> Saturday, June 23, 2012 1:00 PM<br><b>To:</b> Ateljevich, Eli<br><b>Cc:</b> cmake@cmake.org<br><b>Subject:</b> Re: [CMake] FindHDF5.cmake configuration -- finds regular, can't find HL<o:p></o:p></span></p></div></div><p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p><div><p class=MsoNormal style='margin-bottom:12.0pt'><span style='color:black'>I reported this awhile back:<br><br>http://public.kitware.com/Bug/view.php?id=12316<br><br>The patch I attached would work, but it fails in some select cases so it wasn't put in. I don't remember the details, it may fail when there is no HL or something. But you can try it and see if it works for your case.<br><br>Tim<o:p></o:p></span></p><div class=MsoNormal align=center style='text-align:center'><span style='color:black'><hr size=2 width="100%" align=center id=zwchr></span></div><div><p class=MsoNormal style='margin-bottom:12.0pt'><b><span style='font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black'>From: </span></b><span style='font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black'>&quot;Eli Ateljevich&quot; &lt;eli@water.ca.gov&gt;<br><b>To: </b>cmake@cmake.org<br><b>Sent: </b>Saturday, June 23, 2012 3:57:03 PM<br><b>Subject: </b>[CMake] FindHDF5.cmake configuration -- finds regular, can't find HL</span><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black'><o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:black'>Hi all,<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:black'>I am supporting cmake version 2.6. I have included the latest FindHDF5.cmake file I could find in my distro … except for one dependency that needed to be added, this seems to work fine.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:black'>&nbsp;<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:black'>When I try to find_package(HDF5 COMPONENTS … ) it works for the C (and Fortran) component but not for the HL library or Fortran_HL. Here is the output for the C language HL variant:<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:black'>-- Found HDF5: HDF5_hdf5_hl_LIBRARY_RELEASE-NOTFOUND;/usr/local/dms/pkg/hdf5/1.8.7-intel12.0-parallel/lib/libhdf5.a;/usr/lib64/libz.so;/usr/lib64/libm.so<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:black'>&nbsp;<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:black'>Could it be cmake is looking for the unadorned libhdf5.a for the regular library and libhdf5-release or something like that for the hl library. Why the difference? If so is this a type of behavior that can be switched off? <o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:black'>&nbsp;<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:black'>Here are the contents of the directory, in case the issue of the HL libraries not being there comes up:<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:black'>$ ls /usr/local/dms/pkg/hdf5/1.8.7-intel12.0-parallel/lib<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:black'>libhdf5.a&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; libhdf5_hl.a&nbsp;&nbsp; &nbsp; libhdf5_hl.la<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:black'>libhdf5_fortran.a&nbsp;&nbsp; libhdf5hl_fortran.a&nbsp;&nbsp; libhdf5.la<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:black'>libhdf5_fortran.la&nbsp; libhdf5hl_fortran.la&nbsp; libhdf5.settings<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:black'>&nbsp;<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:black'>Thanks for any insight. I realize numerous patches have been made to FindHDF5.cmake, and that I might be voiding my warranty by backwards porting it, but it sure seems like it should work for all the components if it works for two of them.<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:black'>&nbsp;<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='color:black'>Eli<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Helvetica","sans-serif";color:black'><br>--<br><br>Powered by www.kitware.com<br><br>Visit other Kitware open-source projects at http://www.kitware.com/opensource/opensource.html<br><br>Please keep messages on-topic and check the CMake FAQ at: http://www.cmake.org/Wiki/CMake_FAQ<br><br>Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>http://www.cmake.org/mailman/listinfo/cmake<o:p></o:p></span></p></div><p class=MsoNormal><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Times New Roman","serif";color:black'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p></div></div></body></html>